新知榜官方账号
2023-11-13 22:20:18
LumenBioscience公司通过使用机器学习(ML)进行多变量数据分析,将其治疗性蛋白质生产方法提高了70%-100%。为了优化这些因素,该公司与GoogleAcceleratedScience(GAS)合作,使用96个光生物反应器,研究生产结果与17个环境变量之间的关系。最优参数此外,根据现有的先入为主的观念,ML找到了其最优参数,而用DOE可能无法确定这些参数。
Thechallengewastooptimizethehighgrowthrateofspirulina,thephotosyntheticmicrobeLumenusestoproducerecombinantproteinsforitsvaccinesandtherapeutics,whilesimultaneouslyachievinghighexpressionoftheproteins.Toachievesuchresultsrequiredasignificantinfluxofaccuratedata,notesGamble,“sowefocusedonahigh-throughputfluorescentproteinassayforourreadout.ApplyingMLalsorequiredcarefulconsiderationofhowtostructureourmorecomplex,light-scheduleparametersandrewardfunction.“MLhasawayofarrivingatsolutionsthatyoumaynothaveanticipated,soitwasimportantforustofullyconsiderwhetheroptimizationofourrewardfunctionwouldleadtopracticalsolutions.Theapproachwasrelativelyrobusttoobservationnoiseandnon-linearinteractions,anditallowedustoexploreacomplexsubspacewithlightrampingandcycliclightingschedules。
Gamble博士指出,要获得这样的结果,需要大量准确的数据,“所以我们专注于通过高通量荧光蛋白分析来进行读数。应用ML还需要仔细考虑如何构造我们更复杂的、光程的参数和奖励函数。该方法对观察噪声和非线性交互相对稳健,它允许我们能够探索具有光渐变和循环照明时间表的复杂子空间。”
Lumen公司会继续探索多种培养基参数,但Gamble博士表示它还不需要对菌种背景引入任何重大变化。该团队目前正在以引入遗传和环境变量以进一步优化参数。在介于第5周和第15周时,该公司找出了多个生物反应器设置配置,而这些配置使得生产力提高了近一倍。在此过程中,该公司添加了一些将继续应用的控制和规范标准,以帮助确保观察到的结果来自确定而不是隐藏的变量。
相关工具
相关文章
推荐
阿里Accio中文版上线!一键搞定复杂采购
2025-08-19 09:13
视频“用嘴编辑”的时代来了,但钱包顶得住吗?
2025-08-15 17:59
智谱新模型GLM-4.5V全面开源,玩家们有福啦!
2025-08-12 17:56
扎心文案+AI插画=爆款!揭秘8万赞视频的制作全流程
2025-08-12 10:08
GPT-5没你想的那么好,附实测体验~
2025-08-11 11:07
一站式搞定AI绘图+视频,AI短片效率飙升的秘密在这儿!
2025-08-08 09:26
打工人新神器!10款国产AI,让你告别996!
2025-08-08 09:24
豆包视觉推理深度体验,AI也能“边看边想”了!
2025-08-08 09:19
300美元的AI男友来了!马斯克的情感生意从女友做到男友
2025-08-01 17:56
Agent智能体:2025年企业新员工,月薪仅需一度电?
2025-07-30 17:49